Istnieją dwie metody sterylizacji instrumentów medycznych stosowanych w chirurgii, a mianowicie sterylizacja w wysokiej temperaturze i sterylizacja w niskiej temperaturze.
1. Metoda sterylizacji w wysokiej temperaturze polega na użyciu wysokiej temperatury do denaturacji białek drobnoustrojów, aby osiągnąć cel zabijania bakterii. Jest to najczęściej stosowane klinicznie, a powszechnie stosowana jest sterylizacja parą ciśnieniową, która jest odpowiednia dla instrumentów i artykułów odpornych na wysoką wilgotność i ciepło. Istnieje również błyskawiczna sterylizacja parowa, która może być stosowana do gołych narzędzi i przedmiotów.
Po drugie, sterylizacja w niskiej temperaturze, często przy użyciu sterylizacji tlenkiem etylenu. Najbardziej kliniczna aplikacja, zaletą jest to, że nie uszkadza sterylizowanych przedmiotów, ma dużą siłę penetracji i ma dobry efekt zabijania mikroorganizmów. Niskotemperaturowa sterylizacja parą formaldehydową może być stosowana w przypadku urządzeń medycznych, które nie wytrzymują wysokich temperatur.
